Вообще то в данном случае вопрос к качеству учебника, а  не к науке! С преподаванием эволюционной теории у нас проблемы ещё с советских времён. Показательно даже то, что вы упорно наываете это дарвинской теорией эволюции. Хотя теория эволюции Дарвина, уже давно просто исторический этап, так же как и теория Ламарка! Сейчас используется синтетическая теория эволюции, которая хотя во многом и основывается на теории Дарвина, но достаточно далеко от неё ушла!
По поводу ученых выступающих против эволюции!
Что бы говорить о мнении учёных надо читать не статьи в газетах. А труды этих учёных!
Критика теории эвлюции существует! Обязана сществовать! Иначе бы это не было наукой!Как и в любой теории в ней постоянно ищут ошибки и исправляют! Если вдруг вы не в курсе, наука вообще развивается таким образом! В этом её отличие от религии, в науке нет вещей в которых нельзя сомневаться.
«Ни жизнь, ни первая клетка так просто сами появиться не могли» Где это такое академик Шувалов сказал! Полную ссылку в студию! А то любимая тема у креационистов, выдрать цитату из контеста и размахивать ею! Как правило, потом выясняется, что человек говорил нечто другое! Так и в данном случае! А что он мог ещё сказать?! Если это так и есть! Если в природе складываются соответствующие условия то появление жизни не случайность, а закономерность! 
По поводу Алтухова та же история! Приведите цитаты из его трудов где утверждается, что теория эволюции не верна! То что у него имелись возражения это то верно, но в этом нет ничего особенного! Я попробую в сети найти что нибудь из его работ почитать. Но пока  больше нашёл возмущённых выскаываний его коллеги и учеников, по поводу того, что имя учёного беззастенчиво используется в креационистской пропоганде! Причём без всяких на то оснований.
А по поводу доказательтв эволюции посмотите хотя б это! Палеонтология и макроэволюция
Лекция Кирилла Еськова
http://polit.ru/lectures/2008/04/10/paleontolog.html