Смотри Бытие 2:7 (...и стал человек душею живою). Интересно также понятие души в Бытие гл.46, где также ясно видно, что душа - это и есть (в данном случае) живой человек.
В более полном смысле душа - это любое дышащее (т.е. живое) существо, будь то человек, животное, рыба или птица. Однако в Библии нигде не упоминатся, что душа имеется у растений. И это логично, ведь они не имеют лёгких или жабр. Они не дышат.